牡丹SSR分子标记的开发及其在亲缘关系分析中的应用

• 花匠小妙招
• 2024-11-02 14:55

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目录

1．引言

1．1．遗传标记的发展概况

1．1．1．形态标记

1．1．2．细胞学标记

1．1．3．生化标记

1．1．4．分子标记

1．2．SSR标记的开发及其在植物研究中的应用

1．2．1．SSR标记的特点

1．2．2．SSR标记的开发方法概述

1．2．3．SSR标记在植物研究中的应用

1．3．牡丹亲缘关系研究进展

1．3．1．牡丹组种间亲缘关系研究进展

1．3．2．牡丹组品种间亲缘关系研究进展

1．3．3．牡丹组种与品种间亲缘关系研究进展

1．4．本研究的目的意义及技术路线

2．牡丹SSR标记的开发及通用性检测

2．1．实验材料

2．2．实验方法

2．2．1．提取基因组DNA

2．2．2．选择适当的限制性内切酶处理基因组DNA

2．2．3．SuperSNX24接头与DNA片段连接

2．2．4．Dynabead磁珠富集含微卫星序列的DNA片段

2．2．5．含微卫星序列的DNA片段与质粒载体连接

2．2．6．DNA片段与载体连接后的转化

2．2．7．筛选阳性克隆

2．2．8．PCR检测阳性克隆并测序

2．2．9．分析序列并设计引物

2．2．10．筛选引物

2．2．11．多态性引物筛选及通用性研究

2．2．12．丙烯酰胺凝胶电泳

2．3．结果与分析

2．3．1．基因组DNA提取

2．3．2．限制性内切酶处理基因组DNA

2．3．3．接头与DNA片段连接后的PCR扩增

2．3．4．Dynabead磁珠富集含微卫星的DNA片段

2．3．5．筛选阳性克隆并用PCR检测后测序

2．3．6．序列分析及引物设计

2．3．7．筛选引物

2．3．8．筛选多态性引物

2．3．9．引物的通用性检测

2．4．讨论

2．4．1．凤丹基因组DNA的提取

2．4．2．限制性内切酶的选择

2．4．3．微卫星的富集效率

2．4．4．微卫星重复基元

2．4．5．引物通用性检测

3．牡丹亲缘关系分析

3．1．材料与方法

3．1．1．实验材料

3．1．2．提取基因组DNA

3．1．3．荧光PCR检测

3．1．4．数据分析

3．2．结果与分析

3．2．1．SSR标记的遗传多样性分析

3．2．2．牡丹群体的聚类分析

3．2．3．牡丹群体的主成分分析

3．3．讨论

3．3．1．SSR标记的遗传多样性

3．3．2．聚类分析与主成分分析

4．结论

缩略词

参考文献

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导师简介

获得成果目录

致谢

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