蛋白与DNA互作可视化系统提升作物育种效率
近日，中国农业科学院生物技术研究所棉花生物技术设计育种创新团队开发了一种用于验证蛋白与DNA互作的SRS（SGR1-based reporter system）系统，该系统具有高效、可靠、智能化、可视化功能。相关研究成果发表在《植物生物技术杂志（Plant Biotechnology Journal）》上。
近年来，RNA-Seq、ChIP-Seq等组学技术推动了转录因子下游基因的规模化发现，但在植物体内快速且准确地验证转录因子直接结合的下游靶基因依然具有挑战性。
该研究通过使用叶绿素降解基因，开发了一个能够通过观察植物叶片颜色变化进行可视化报告的系统，并配套开发追踪颜色变化的智能模型SMGY。目前，团队开发的SRS系统已在水稻、棉花、辣椒等多种作物中成功验证了5组不同类型的转录因子与DNA的互作，并证明该系统同样适用于非烟草物种，如油菜和生菜等。SRS系统的开发为构建基因遗传调控网络及作物智能设计育种提供了一种新的技术方法。
该研究得到了科技创新2030重大项目、国家重点研发计划、国家自然科学基金、中国农业科学院科技创新工程等项目资助。（通讯员：崔艳）
原文链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14488
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