解码日本牵牛花基因组
2016年11月，日本国家基础生物学研究所报道，该所研究人员成功解码了日本牵牛花（Ipomoea nil）的全部基因组。在日本, 牵牛花是一种很受欢迎的传统园林植物，夏天在很多花园可以见到。从约200年前的江户时代开始，人们就开始培育、欣赏这种长有奇形异状花瓣和叶子的牵牛花，这成为日本的一种独特的园艺文化。由于其“跳跃基因”（又称转座子，transposons）的作用，牵牛花经常发生基因突变。
由于“突变的牵牛花”很流行，研究人员收集了很多自然突变体。他们利用整个基因组序列表征了拥有深绿色、厚实、褶皱叶子的矮小型牵牛花的突变体。通过对这些突变体的详细分析，发现很多决定花瓣、叶子形状以及花色和花纹的基因。同时还发现了一种植物激素生物合成基因，这种基因可受到突变体中转座子的干扰。
日本庆应义塾大学（Keio University）的神原安文（YasubumiSakakibara）教授是该项研究的带头人之一，负责本研究中的基因组搭配和生物信息学分析。他说：“我们得到了一个近乎完整的高质量基因组序列，数量达到约43,000个。同时掌握了牵牛花转座子的数量及其分布情况，由此，我们可培育大量具有不同颜色和形状的牵牛花品种。”
日本九州大学（Kyushu University）讲师、国家生物资源项目（National BioResourse Project, NBRP）牵牛花计划负责人仁田坂英二（EijiNitasaka）表示：“基因组解码后，极大地提高了将日本牵牛花作为一种模式生物加以利用的价值。我希望，日本牵牛花及其突变体可为全世界更多研究人员所利用。”该项目研究的带头人之一、日本基础生物学研究所（National Institute for Basic Biology）助理教授星野淳史（Atsushi Hoshino）也表示：“日本牵牛花的基因组序列不仅有助于人们了解牵牛花，也可用于与之联系密切的作物，如甘薯等的研究中。”该项研究成果发表在《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。
（编译 潘淑春）
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