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鬼臼亚科系统发育与八角莲属的亲缘地理学研究

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目录

第1章 前言

1.1 研究背景

1.1.1 鬼臼亚科分类和分子系统学研究

1.1.2 八角莲属的形态解剖学研究

1.1.3 八角莲属的繁育系统学研究

1.1.4 八角莲属的植物化学研究

1.1.5 八角莲属的群体遗传学研究

1.1.6 八角莲属的生物地理学研究

1.1.7 八角莲属研究存在的问题

1.2 研究内容和研究目的

1.2.1 研究内容

1.2.2 研究目的

1.2.3 技术路线

第2章 鬼臼亚科的系统发育与八角莲属的生物地理学研究

2.1 实验材料

2.2 实验方法

2.2.1 基因组总DNA提取

2.2.1 序列扩增及测序分析

2.2.2 八角莲属分化时间的估算

2.2.3 祖先分布区重建

2.3 实验结果

2.3.1 八角莲属系统发育关系和分化时间的估算

2.3.2 祖先分布区重建

2.4 讨论

2.5 小结

第3章 八角莲属种水平的亲缘地理学研究

3.1 八角莲属野外资源调查

3.2 叶绿体DNA序列分析

3.2.1 实验材料

3.2.2 实验方法

3.2.3 实验结果

3.3 ITS序列分析

3.3.1 实验材料

3.3.2 实验方法

3.3.3 实验结果

3.4 讨论

3.5 小结

第4章 鬼臼亚科的生物条形码研究

4.1 实验材料

4.2 实验方法

4.2.1 筛选引物

4.2.2 PCR反应体系及扩增程序

4.2.3 DNA条形码多态性检测

4.2.4 种内和种间变异的评估

4.2.5 DNA条形码物种鉴定能力的评估

4.2.6 DNA条形的单系物种重建率评估

4.2.7 DNA Barcoding gap检验

4.3 DNA条形码结果与分析

4.3.1 筛选引物信息及扩增、测序结果

4.3.2 DNA条形码多态性分析

4.3.3 种内种间变异评估分析

4.3.4 DNA条形码鉴定能力分析

4.3.5 基于构建系统进化树的方法评估DNA条形码可靠性

4.3.6 DNA Barcoding gap分析

4.4 讨论

4.4.1 鬼臼亚科候选条形码的评估

4.4.2 DNA条形码在鬼臼亚科中的应用限制

第5章 比较转录组及CYP719A基因的分子进化研究

5.1 实验材料

5.2 实验方法

5.2.1 RNA提取及Illumina转录组测序

5.2.2 功能注释和CDS预测

5.2.3 直系同源基因的鉴定和碱基替换率的估算

5.2.4 属水平EST-SSR引物开发

5.2.5 单拷贝核基因的鉴定

5.2.6 鬼臼毒素合成路径相关基因的搜索和分子进化分析

5.3 实验结果

5.3.1 八角莲和云南八角莲转录组测序

5.3.2 功能注释及CDS预测

5.3.3 直系同源基因的鉴定和碱基替代速率的计算

5.3.4 属水平EST-SSR引物开发

5.3.5 鉴定单拷贝核基因

5.3.6 鬼臼亚科中CYP719A基因的进化

5.4 讨论

5.5 小结

第6章 八角莲属的整合分类系统与资源保护

6.1 八角莲属的整合分类系统

6.2 八角莲属的资源保护策略

6.2.1 进化显著单元的确定和“迁地(ex situ)”保护策略

6.2.2 八角莲属的“就地(in situ)”保护策略

第7章 结论和展望

7.1 结论

7.2 展望

参考文献

附录

在读期间的主要成果

致谢

相关知识

四照花亲缘地理学与景观遗传学的初步研究
报春花属的保育遗传学及亲缘地理学研究进展
中国四川菜花露尾甲亚属一新种(鞘翅目:露尾甲科)(英文)
五种蝽科昆虫的细胞分类学研究(半翅目:异翅亚目)
吉林省天牛科昆虫分类学研究
铁线莲属植物遗传标记的研究进展.doc
[翻译] 仙女杯属:三个亚属与演化史
丁香属3种植物完整叶绿体基因组与系统发育研究
东亚珍稀濒危植物细茎石斛的亲缘地理学和保护遗传学研究
基于ITS序列分析豹子花属与5种百合的亲缘关系

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所属分类:花卉
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