微生物游离 DNA 的血浆宏基因组下一代测序检测疑似感染胰腺坏死患者的病原体,BMC Infectious Diseases
微生物游离 DNA 的血浆宏基因组下一代测序检测疑似感染胰腺坏死患者的病原体
BMC Infectious Diseases ( IF 3.4 ) Pub Date : 2022-08-05 , DOI: 10.1186/s12879-022-07662-2
Donghuang Hong 1, 2 , Peng Wang 3 , Jingzhu Zhang 3 , Kaiwei Li 3 , Bo Ye 3 , Gang Li 3 , Jing Zhou 3 , Zhihui Tong 3 , Lu Ke 3, 4 , Songjing Shi 2 , Weiqin Li 1, 3, 4
感染性胰腺坏死（IPN）是急性胰腺炎（AP）的危及生命的并发症。及时诊断 IPN 可以促进适当的治疗，但缺乏可靠的非侵入性筛查测试。在本研究中，我们旨在评估基于循环微生物游离 DNA 的血浆宏基因组下一代测序 (mNGS) 在疑似 IPN 患者中的诊断价值。从 2020 年 10 月到 2021 年 10 月，我们回顾了 44 名接受血浆 mNGS 的疑似 IPN 患者。将指标采血后两周内 IPN 的确诊诊断视为参考标准。IPN 的确认依赖于从坏死集合中获得的排水管的微生物学结果。分析了血浆mNGS鉴定的病原体分布。根据整体 mNGS 结果与 IPN 引流管培养结果之间的一致性评估正百分比一致性 (PPA) 和负百分比一致性 (NPA)。此外，比较了 mNGS 阳性和阴性患者的临床结果。在所有研究样本中，mNGS 检测到了 13 种细菌和 5 种真菌。血浆mNGS阳性率为54.55%（24/44）。在 24 例 mNGS 阳性病例中，20 例（83.33%，95% CI，68.42-98.24%）与 IPN 引流管的培养结果一致。IPN 的血浆 mNGS 的 PPA 和 NPA 分别为 80.0%（20/25；95% CI，64.32–95.68%）和 89.47%（17/19；95% CI，75.67–100%）。与 mNGS 阴性组相比，阳性组患者新发感染性休克的比例更高 [12 (50.0%) 对 4 (20.0%)，p = 0.039]。IPN 相关病原体可以通过血浆 mNGS 识别，可能有助于适当的治疗。mNGS 在该队列中的临床应用似乎是可行的。
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更新日期：2022-08-06
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