辣椒属蔗糖合酶基因家族的鉴定及表达
辣椒属蔗糖合酶基因家族的鉴定及表达
【摘要】：蔗糖合酶(sucrose synthase, SUS)是植物蔗糖代谢关键酶之一,在植物生长发育和抵御逆境胁迫中具有重要的作用。辣椒基因组的公布为挖掘和鉴定SUS提供了机遇。本研究基于已经公布的5个辣椒基因组数据信息,利用信息生物学方法对辣椒蔗糖合酶基因家族成员进行鉴定,分析其染色体定位、系统进化关系及表达模式。结果表明:5个辣椒基因组共编码25个SUS蛋白,每个辣椒种均编码5个成员;编码氨基酸长度在787～972 aa之间,等电点范围位于5.85～8.26之间,分子量大小为87.96～110.27 kD;染色体定位发现一年生栽培辣椒5个SUS基因(Capanasus1～Capanasus5)分布于4条染色体上,其中Capanasus3和Capanasus5基因位于三号染色体;系统进化树将SUS基因分为3个不同的区组(SUSⅠ～SUSⅢ),这与模式植物拟南芥分类相一致;通过RNA-seq分析发现,2个SUS基因(Capanasus1和Capanasus2)在花、果皮和种子发育中高度表达,而在叶片中表达量很低,剩下3个基因(Capanasus3, Capanasus4和Capanasus5)在所有组织(花,叶,果皮和种子)发育中表达量较低,甚至不表达。进一步研究发现3个SUS基因(Capanasus1, Capanasus2和Capanasus3)受到多种激素(ABA, GA, IAA和JA)的诱导,而剩下的Capanasus4和Capanasus5基因几乎没有变化;此外,在逆境处理条件下,辣椒SUS基因(Capanasus1, Capanasus2和Capanasus3)呈现显著的差异表达,而Capanasus4和Capanasus5基因的表达量没有显著变化。这些结果为进一步深入研究辣椒SUS基因的功能提供了理论依据。
相关知识
茉莉花PAL基因家族的多基因组鉴定与表达分析
芸薹属大白菜Aux/IAA基因家族的生物信息学分析
谷子SiCIN基因家族的全基因组鉴定及功能分析
向日葵YABBY基因家族鉴定及表达分析
辣椒幼苗灌根接种疫霉菌侵染后叶片基因差异表达谱分析
管花肉苁蓉花中查耳酮合酶的基因克隆、功能鉴定与表达分析
桂花萜烯合酶(TPS)的生物信息学与原核表达分析
人工老化对玉米种子萌发初期可溶性糖类代谢关键酶及相关基因表达的影响
响应槲皮素诱导的美国白蛾GST基因鉴定及表达分析
建兰ABC基因家族鉴定及其在花发育过程中的表达模式分析
网址: 辣椒属蔗糖合酶基因家族的鉴定及表达 https://m.huajiangbk.com/newsview1182460.html
| 上一篇: 辣椒属目前已经鉴定栽培种有5个。 |
下一篇: 辣椒属的形态特征 |
