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第十二章分子标记技

花匠小妙招
2024-10-23 16:46

第十二章园艺植物的分子标记
第一节园艺植物遗传标记概述
一、遗传标记
遗传标记(ic markers)
是指园艺植物基因型特殊的、易于识别的表现形式,包括外部形态、染色体结构与数目、生物大分子结构与序列等方面的变异,而所有的遗传标记则构成了园艺植物的遗传多态性。
遗传标记种类
形态标记、细胞学标记、生化标记、分子标记
第一节园艺植物遗传标记概述
一、遗传标记
遗传标记特点
,标记数目多,提供的信息量大;
,能区分纯合基因型和杂合基因型;
,不影响目标性状表达,与不良性状无必然连锁;
,不受植株内外环境的影响;
,易于观察记载。
概念:能明确反映遗传多态性的外观性状,如株高、果形、花色、叶形、花瓣数多少、核有无或抗逆性、抗病性等。
特点:简单直观,长期以来,作物种质资源鉴定及育种材料的选择一般都是根据形态标记进行的,但是形态标记数目少,多态性差,易受环境因素的影响等。
形态标记(Morphological marker)
形态学上如何区分
概念:能明确反映遗传多态性的细胞学特征。
染色体结构特征包括核型(染色体相对长度、臂指数、着丝粒指数、染色体臂数等)和带型(Constitutive heterochrom -ative banding带、anizer region banding带、Giemsa banding带等)。
染色体数量特征包括整倍性(多倍体)和非整倍性(缺体、单体、三体、端着丝点染色体等)。
方法:染色体计数、染色体显带
优点:较形态学标记稳定,可靠
缺点:过程复杂、对材料和仪器要求严格
细胞学标记(Cytological marker)
人类22对常染色体
染色体组型 karyotype (Chromosome phenotype) analysis
细胞分裂中期(Metaphase)
Less polymorphic
Used for distant related plants or evolutional analysis
概念:主要包括贮藏蛋白、同工酶等标记,也指以基因表达的蛋白质产物为主的一类遗传标记系统。
种类:可分为酶蛋白质和非酶蛋白质两类。在非酶蛋白质中用得最多的是种子贮藏蛋白(清蛋白、球蛋白、醇溶蛋白和谷蛋白)。
同工酶(isoenzyes):催化功能相同,但结构和生理性质不同的一类酶。
生化标记的优点:数量更丰富,受环境影响更小。
生化标记的缺点:蛋白质受生物体发育的时空影响很大。
生化标记(Biochemical Marker)
分子标记(DNA marker)
概念:是以直接检测DNA核苷酸序列的差异为基础的遗传标记,又叫DNA分子标记。
优点:标记不需要基因表达,可用个体的任何材料进行检测,不受环境条件的限制;数量多,遍布整个基因组;多态性高,自然界存在着许多等位变异,不需专门创造特殊的遗传材料;有许多分子标记表现为共显性,能够鉴别出纯合基因型和杂合基因型,提供完整的遗传信息;有效区分不同物种之间的同源性和相似性;标记本身无害,很少与不良性状连锁;多是以DNA片段电泳谱带形式表现的。
分子标记(DNA marker)
概念:是以直接检测DNA碱基序列的差异为基础的遗传标记,又叫DNA分子标记。
分类:
-DNA杂交的标记(RFLP、VNTR等)
(SSR、RAPD、AFLP等)
(SSCP等)
(SNP等)